Sérotypage de Salmonella

NeoSeek™ Salmonella Serotyping

Réf. d’article  NSSERO

  • Détermination du sérotype de Salmonella en utilisant des résultats de tests spécifiques à l’ADN.
  • Délai d’exécution de 72 heures, soit plusieurs jours plus rapide que des méthodes traditionnelles se basant sur les anticorps.
  • La base de données de la séquence identifie plus de 1500 autres sérotypes de Salmonella, y compris les 30 principaux sérotypes préoccupants selon le CDC.
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NeoSeek™ est un service révolutionnaire de détection et d’identification des agents pathogènes qui fournit des sérotypes se basant sur la génomique (comme Salmonella enterica Enteritidis et Salmonella enterica Heidelberg) dans un délai de 72 heures et à partir d’isolats présumés positifs pour Salmonella. Un service similaire de détection et d’identification des STEC est également disponible. La technologie NeoSeek utilise la PCR de l’amplicon ciblé avec le séquençage de nouvelle génération afin de développer un profil génétique pour l’isolat de la colonie, puis compare ces résultats de la séquence avec la composition génétique connue de la base de données de référence afin de déterminer le sérotype spécifique de Salmonella qui est présent. Consulter les informations sur la technologie.
Spécifications
Analyte Salmonella
Brand NeoSeek™
Plateforme Moléculaire

Los elementos clave para la genómica de seguridad alimentaria incluyen tres áreas críticas. Estos tres aspectos son aprovechados con NeoSeek™ a través de varios socios y laboratorios existentes.

Tecnología de secuenciación

Illumina es la plataforma usada para la mayoría de las aplicaciones de secuenciación de nueva generación (NGS) en los ensayos NeoSeek. Estos secuenciadores han permitido que los costos de adquisición de datos bajen drásticamente. Esto permite que el servicio se implemente a mayor escala y más allá de los laboratorios de investigación utilizados en universidades y otras organizaciones de investigación.

Laboratorio y capacidades de GeneSeek®

GeneSeek en Lincoln, Nebraska es el laboratorio de genómica animal más grande del mundo. NeoSeek utiliza la infraestructura existente para procesar muestras rápidamente con resultados de alta calidad. Este laboratorio con acreditación ISO 17025, ha estado proporcionando resultados genéticos durante más de una década.

Bioinformática

Utilizando procesos personalizados y bases de datos curadas, la bioinformática es un elemento crítico para generar resultados significativos y de alta calidad. La bioinformática también ayuda a estructurar los datos para generar resultados significativos y procesables.

NEOGEN® es el licenciatario exclusivo de procesos y análisis de Metagenome Analytics (MGA). Estos servicios proporcionan el desarrollo y utilización de la bioinformática para los ensayos NeoSeek. MGA se compone de los principales expertos en el microbioma alimentario y aplicaciones de seguridad alimentaria de secuenciación de nueva generación.

La bioinformática es el proceso de ensamblaje e interpretación de datos de secuencias para aplicaciones como la secuenciación metagenómica del 16S, secuenciación del genoma completo o la metagenómica del genoma completo. Los millones de lecturas que acompañan cada aplicación necesitan poder de computación y programas para ensamblar las secuencias e interpretar los datos. MGA mantiene bases de datos, procesos bioinformáticos patentados y funciones de informes de clientes para ayudar a ofrecer información clave con la secuenciación de nueva generación.

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